汉朝时代，西域(今新疆)正式纳入中原王朝的统治。然而唐朝以后，西域逐渐游离于中原以外，先后出现了回鹘、察合台、叶尔羌等众多地区势力。蒙古帝国土崩瓦解以后，蒙古的一个分支——卫拉特蒙古(漠西蒙古)占据了西域地区。自唐代以来，西域地区与中央王朝已经失去联系上千年，清朝为什么要收复西域地区呢?
其实有很多的原因，清王朝立国的基础就是满蒙一体，蒙古各个部落和地区的人，财力，军事支持，再加上蒙古高原的优势，是清王朝统一中原的重要原因。如果没有蒙古，清王朝的兵力和人力无法控制中原，所以历朝历代的清王朝皇帝加强和蒙古的联系，甚至想法设法的渗透进蒙古各个地区的人和事。
所以，对于清朝，蒙古不能有失，就像葛尔丹，他们甚至想控制蒙古和西域夺取清王朝的统治，如果控制了，那么不光后院起火，清朝也得回到原来的地区。这也是不容允许的，所以历朝历代的统治者前仆后继的派兵镇压西域各部落，这样，才能保证他们一心一意的听从清王朝。不然，漠西一日没有安宁，清王朝也一日也活在不安中。