艾滋病病毒有可能是近现代才变异出来，也可能自古就有艾滋病病毒。就算是自古就有，在古代也不会被人发现。
有些病毒，是某一种动物携带的，这种病毒在动物身上没有伤害，因为这种动物自己就有抗体，比如老鼠、蝙蝠、科莫多巨蜥都携带有很多细菌、病毒。但一旦这种病毒被传播到了人的身上，人的抵抗系统不认识这种病毒，不知道该怎么消灭，那么人可能就会死亡，更可怕是这种病毒可能传染，比如打喷嚏传染感冒病毒。
随着欧洲十字军东征，结果从亚洲带回了鼠疫，也就是黑死病，直接让欧洲死亡了三分之一人口。这种人口的流动就使得病毒也流动。
欧洲人到达美洲，也带去了病毒，这些病毒在欧洲人身体里是没关系的，因为人已经能够识别出这些病毒，产生抗体。但隔绝于世界几千、几万年的印度安人，完全没遇到过这种病毒，结果大量死亡，一死就是一个部落。
艾滋病也是，北非干旱地区和亚洲、欧洲接触比较多，但这个地方沙漠物种较少，也不携带艾滋病病毒。但非洲南部，热带雨林、热带草原，动物种类繁多，比如现在推测是大猩猩携带艾滋病病毒。可是非洲南部在古时候和亚洲、欧洲没有往来，一直到近代殖民时代，才和其他地方发生人口流动。
所以即使古代就有艾滋病病毒，也仅限于非洲南部之间传播。但在古代交通不便，人口流动小，都是部落式的居住，所以艾滋病也无法大范围传播。
至于艾滋病病毒怎么传染到人身上的，就不确定了，可能是某个人和黑猩猩打斗，产生了血液传播。