朱元璋称帝后，与洪武三年册封李善长、徐达、常茂、李文忠、冯胜和邓愈等6人公爵，另外28人为侯爵，并赐给大量田地。朱元璋为了确保功臣忠心，巩固自己的皇位，还让皇室与功臣联姻。从此时来看，功臣集团和朱元璋的关系还是和睦、互利的。
然而没过几年，朱元璋便开始发现当初与他一起打天下的文臣武将开始不守规矩了，这使得他开始害怕好不容易用命拼来的皇位会给他们搞垮了，他不想，也绝对不能让元朝灭亡的腐败之风发生在新朝廷中。洪武五年，朱元璋颁布《铁榜文》对文武功臣严加饬，严加指责他们违法乱纪的行径。这可以看出是朱元璋对骄傲放纵的功臣的一张警告，也是他们关系开始变得紧张的一个信号。洪武八年朱元璋制作了《资世通训》，洪武十三年制作《臣戒录》，警告大臣们如果对天子不忠，愈越礼制，将受严惩。而正是这时，朱元璋已经对这些功臣武将举起了屠刀，开始实施他的独裁专制和恐怖政治了。
朱元璋为实施他的恐怖政治发明了著名的大明酷刑，有刺、黥、剕、劓、阉和凌迟，而为使新官好好当官，朱元璋把贪官污吏的皮剥了放在衙门公坐上，让新官看了瑟瑟发抖。在他的专制与恐怖政治之下与洪武十三年，胡惟庸案发，御史节中丞涂节商嵩告发胡惟庸南通倭寇北接旧元，意欲谋反。朱元璋命羽林军将胡抓起来，审问得实，磔于市，牵连被杀达3万人。洪武二十三年，有人告发李善长交通胡惟庸情状，朱元璋又将当时77岁的李善长赐死，并诛杀其家，吉安侯陆仲享，延安侯唐胜宗，靖宁侯叶升等因牵连此案被杀。洪武二十六年，又发蓝玉案。蓝玉以谋逆罪被杀，连坐被诛杀者达1.5万人。而胡蓝两案使得大明的开国功勋被屠戮殆尽。
朱元璋对功臣痛下杀手，对无功的文臣更是实施暴政，洪武十五年和洪武十八年发生的空印案和郭桓案被诛连得文臣地主与家室达七八万人。
朱元璋的政权建立在流血屠杀中，酷刑暴行的基础上，从开国元勋到列侯裨将、部将大臣、诸司官吏到进士监生、经生儒士、富人地主僧道屠洁，以至亲侄儿、亲外甥，无人不杀，无人不可杀，一个个地杀，一家家地杀，有罪的杀，无罪的也杀，“大戮官民，不分臧否”，这个时代，这种政治，确确实实是名副其实的恐怖政治。
由上文不难发现，朱元璋的暴政当中处置的大都是官吏和大地主，而对于小民，朱元璋采取的又是另外一种政策。首先朱元璋制定里甲制度将农民的活动范围控制在百里之内，同时明令禁止并打击一切预言类秘密组织，以防止农民聚众生事。朱元璋当时打天下也是靠“明王出世”和“弥勒佛降生”等预言拉拢人心的，所以他深知这类组织的意义。为保王权永治，他必须打击这类组织。
另外朱元璋在平民百姓眼里还有一个慈祥的模样。他经常挂嘴边的话就是“四民之中，农民最辛苦”，“要体恤民情”，“多为民做实事”等，这与他出身于农民有关。朱元璋建国后下令民间除额定需种植的食物外，凡加种棉花的可免除租税，从此棉花种植遍布全国，平民逐渐从穿麻布到棉衣。同时朱元璋还鼓励人民对一切水利提建议，特别吩咐工部官员凡可蓄水的湖堰一一修建以防备水旱灾等。
这一切的利民政策使得朱元璋得到百姓的爱戴和敬重，正所谓“得民心者得天下”，况且朱元璋的暴政主要治理的对象是官吏和大地主，所以他又怎么会被推翻呢？
