第二套房贷款首付不低于四成。根据央行、住建部、银监会三部委发布的通知规定，对拥有一套住房且相应购房贷款未结清的居民家庭购二套房，最低首付款比例调整为不低于40%。使用住房公积金贷款购买首套普通自住房，最低首付20%;拥有一套住房并已结清贷款的家庭，再次申请住房公积金购房，最低首付30%。
在不同的城市对于贷款买房的首付比例还会有具体的规定，在贷款前注意了解所在城市的规定。
第二套房怎么认定的
二套房认定标准有三种：认房又认贷、认房不认贷、认贷不认房。其中认房是看买家在当地房屋登记系统中是否已经有了登记信息。认贷是看买家在银行征信系统里是否已经登记有贷款买房的信息。
1、认房又认贷
以家庭为单位，既看名下是否有房产，也看贷款情况。
①既没有房产，也没有贷款买房记录，购房算首套房;
②名下有一套房产，或者有贷款买房记录，再次购房算二套房。
注：首套房、二套房认定标准都是以家庭为单位，家庭由三种人组成本人、配偶、未成年子女。
2、认房不认贷
以家庭为单位，只看名下是否有房产，不管贷款情况。
①名下无房产，购房算首套房;
②名下有一套房产，再次购房算二套房。
3、认贷不认房
以家庭为单位，只看贷款是否结清，不管名下房产情况。
①贷款已结清，再次购房算首套房;
②贷款未结清，再次购房算二套房。
第二套房和首套房贷款区别
1、首付比例
如果是在不限购限贷的城市里购买的是首套房的话，即便购房者是通过商业贷款的方式来购买房屋，那么首付比例一般在20%左右，如果是购买二套房的话，商业贷款的首付比例则为30%以上。
2、贷款难度
由于在申请贷款的时候，很多购房者都遇到过被银行拒贷的情况，通常首套房在申请贷款的时候是比较容易的，而二套房想要申请贷款的话难度要比首套房大很多，特别是在遇到银行资金紧张的时候，二套房的贷款是很难申请到的。