公元1853年，百万太平军自武昌顺流而下，直取满清的江宁府。而江宁，在清朝时仍被百姓按照明朝旧俗，称为南京。
在攻打南京前，太平军先攻克了九江，击溃了清军陆军主力。而九江一失，南京已经无险可守、无兵可用。
当年2月，太平军乘坐舰船万艘，“蔽江而来”。由于太平军人多势众，轻而易举地将南京城围得水泄不通。要知道，南京城墙长达62里，与今天北京二环线相同。
之后，太平军对南京的城墙，发动了潮水一般的攻势。由于南京城高地深，不易直接攻打。因此太平军使出了他们惯用的“掘地法”，也就是挖掘地道，直到城根，然后用巨量的炸药摧毁城墙。
对于太平军的掘地法，清军手足无措，根本无法应对。在仪凤门，太平军一面攻城，一面挖掘地道。不久后，太平军“土营”官兵便摸到南京城墙下。只听一声巨响，狮山正面的城墙，被炸出宽约两丈余的缺口。守城清军见势不妙，只恨爹妈没给自己多生两条腿，没命地逃跑。就这样，南京外城便被攻破了。
然而南京外城被攻陷，不等于全城被攻破。在南京城中，还有一座满城。所谓满城，即八旗军驻地。满清开国以来，历代皇帝为了防备汉人造反，便在中国各要害之处布下八旗驻防兵。南京被攻破后，部分八旗军便与他们的家属入居于明朝的旧皇城。而旧皇城，也被称为南京满城。
太平军入城后，一边进军一边大喊：“百姓皆闭门，敢出者杀！”于是南京市民纷纷关闭门户，因此几乎没有遭到屠戮。然而相比于普通市民，满城的八旗军民可就没有那么幸运了。
早在入城前，杨秀清就说：“满人皆妖，格杀勿论，妇孺不留。”《奉天讨护檄》中，杨秀清也公开声称“誓屠八旗，以安九有”。
因此太平军围攻满城，根本不会接受城内旗人的投降，而是要将他们全部杀尽。满城八旗见自己已无退路，于是决定据城防守，背城一战。
根据当时人记载，南京满城的城墙又高又坚固，城中军民达3万人之多，因此不易攻克。与此同时，八旗军全民皆兵，即使妇女也会使用火枪和弓箭。因此，满城八旗几乎将所有人都投入城墙，与太平军进行了血战。
据史书记载，此战中太平军死伤惨重，尸体堆积如山，后续士兵甚至能踩着战友的尸体登上城墙。由于寡不敌众，满城最终告破。《东华续录》记载：
“咸丰三年，粤匪窜扰江宁省城，前任江宁将军祥厚、副都统霍龙武以及八旗协佐各官，或力竭捐躯，或临城自尽，文武各官计三百余员，兵丁妇女不下三万人。”
而曾国藩在奏折中同样提到：“当年粤匪攻克江宁，旗营三万余人，几同一烬。”而在《金陵省难纪略》中，还有更可怕的记载：
太平军攻克满城后，将还未被杀的数千名八旗妇孺驱赶到朝阳门外，堆积大量柴薪，将她们全部烧杀。其后，太平军又挨家挨户“搜妖”，而所谓“妖”就是官兵和满人。
二百年前，满人自关外起兵，南下江南时，可谓是杀人如麻，在扬州、江阴等地，都犯下了令人发指的暴行。八旗军攻克南京时，虽然没有进行屠杀。但是持续近200年的仇恨，仍足以将他们埋葬。
在太平军攻破南京前，满城乃是城中之城，汉人不得在其中定居。城中八旗不事生产，还趾高气昂，对汉人颐气指使。一些旗人恶霸更是在皇权的庇护下欺男霸女，他们到处勒索普通汉民，放纵战马啃食农民的庄稼，而这些恶行，甚至连一向护短的乾隆都看不下去，专门颁布圣旨：
“严饬官兵不许倚势横行 强夺市井 及借打草放马为名 侵扰民田 。”
然而乾隆的旨意，并没有阻止南京旗民对普通市民的欺压。因此当太平军攻克满城，百姓们对他们并不同情。
1864年，太平天国灭亡，而江宁满城也得到了重建。而这一次，八旗官兵都学乖了，不再骚扰百姓。因此往后的旗民关系，都变得相对和谐。
时过境迁，辛亥革命时，由革命党所领导的江浙联军合围南京，城中清军自知城池已不可保，因此决定向革命党投降。江浙联军入城后，并没有遵循入城前“不杀旗人”的承诺，苏良斌 、崔英两部在皇城旗 营一带 ， 借口打倒满人为名 ，大肆烧杀抢掠，旗人被害自杀者为数甚多，其状极惨。最终，江宁满城成为了一片废墟。
太平军屠灭满城，固然残忍。但究其根源，要归咎于满清政府的早期屠杀以及中后期的民族歧视政策。清朝皇帝原本想用满城控驭全国，却没成想却让这些殖民性质的城池，变成旗民的活坟墓。