西城
- 北大医院 (三甲, 特色:综合)
- 北大人民医院 (三甲, 特色:综合)
- 宣武医院 (三甲, 特色:神外、神内)
- 阜外医院 (三甲, 特色:心血管)
- 北京友谊医院 (三甲, 特色:综合)
- 北京儿童医院 (三甲, 特色:儿童)
- 北京积水潭医院 (三甲, 特色:骨科,烧伤科)
- 广安门医院 (三甲, 特色:中医)
- 火箭军特色医学中心 (三甲)
- 北京安定医院 (三甲)
- 305医院 (三甲)
- 北京市肛肠医院 (三甲)
- 护国寺中医院 (三甲)
- 北京市回民医院 (三甲)
海淀
- 北京301医院 (三甲, 特色:综合)
- 北医三院 (三甲, 特色:综合)
- 解放军总医院第三医学中心 (三甲)
- 中国中医科学院西苑医院 (三甲, 特色:中医)
- 世纪坛医院 (三甲)
- 解放军总医院第四医学中心 (三甲)
- 北大口腔医院 (三甲, 特色:口腔)
- 中国人民解放军总医院第六医学中心 (三甲)
- 空军特色医学中心 (三甲)
- 北京肿瘤医院 (三甲, 特色:肿瘤)
- 解放军总医院第八医学中心 (三甲)
- 北医六院 (三甲, )
- 北京中西医结合医院 (三甲)
朝阳
- 中日医院 (三甲, 特色:综合)
- 安贞医院 (三甲, 特色:心血管)
- 北京朝阳医院 (三甲, 特色:呼吸)
- 儿研所 (三甲, 特色:儿童)
- 医科院肿瘤医院 (三甲, 特色:肿瘤)
- 战略支援部队特色医学中心 (三甲, 特色:综合)
- 北京妇产医院 (三甲, 特色:妇产)
- 望京医院 (三甲, 特色:中医)
- 北京地坛医院 (三甲, 特色:传染)
- 北京中医药大学第三附属医院 (三甲)
- 北京第一中西医结合医院 (三甲)
- 北京急救中心 (三甲)
东城
- 北京协和医院 (三甲, 特色:综合)
- 北京同仁医院 (三甲, 特色:眼科、耳鼻喉科)
- 北京医院 (三甲, 特色:综合)
- 东直门医院 (三甲, 特色:中医)
- 北京中医医院 (三甲, 特色:中医)
- 解放军总医院第七医学中心 (三甲)
- 北京口腔医院 (三甲, 特色:口腔)
- 和平里医院 (三甲)
- 八一儿童医院 (三甲)
丰台
- 北京天坛医院 (三甲, 特色:神外、神内)
- 北京佑安医院 (三甲, 特色:传染)
- 北京中医药大学东方医院 (三甲)
- 解放军总医院第五医学中心 (三甲, 特色:传染)
- 解放军总医院第五医学中心南院区 (三甲)
- 中国康复研究中心(北京博爱医院) (三甲, 特色:康复)
- 丰台中西医结合医院 (三甲)
石景山
- 北京朝阳医院西院 (三甲)
- 八大处整形医院 (三甲, 特色:整形)
- 中国中医科学院眼科医院 (三甲)
昌平
- 回龙观医院 (三甲, 特色:精神)
- 昌平中医院 (三甲)
- 北京市昌平区中西医结合医院 (三甲)
大兴
- 中国中医科学院广安门医院南区 (三甲)
- 北京同仁医院南区(亦庄院区) (三甲)
通州
- 北京中医药大学东直门医院通州院区 (三甲)
- 北京胸科医院 (三甲)
顺义
- 北京市顺义区中医医院 (三甲)
房山
- 北京中医药大学房山医院 (三甲)
平谷
- 北京中医医院平谷医院 (三甲)