公元1662年（康熙元年）1月22日，缅甸土司将南明永历皇帝本人及其家眷交给了平西王吴三桂，自此，历经三年的朱由榔追击战结束，清王朝消除了统治中原的最大隐患。
吴三桂在抓住朱由榔后，将其绞杀于云南。这个曾经为崇祯皇帝报仇而从山海关攻进中原的军人，最后却亲手扼杀掉了明王朝，这不得不感叹人心之可怕。
当然，与吴三桂一起分享胜利喜悦的是领侍卫内大臣爱星阿，他于1660年率领军队驰援吴三桂。战争结束之后，爱星阿回到京城，而军队则落到了吴三桂手里。
此事发生在康熙皇帝登位的第二个年头，也是小皇帝改元的第一年。如此大的喜事，自然给新皇帝和辅佐新皇帝的大臣们打了一针强心剂。九岁的康熙自然还弄不明白这其中的意义，但是作为辅政大臣之一的鳌拜，却能够深刻体会到这场胜利给他们带来的荣耀。
首先说，南明政权覆灭，国家一统，这笔政绩可以画在他们的头上；再者，作为篡改了顺治遗诏的辅政大臣，在这个时候能够取得一场大的胜利，那自然证明了他们的绝对正确，这在官场上是可遇不可求的大机遇。
要给吴三桂和爱星阿加官进爵，要在清廷的太庙中祭祀，告诉努尔哈赤、皇太极甚至福临，他们完成了先帝们未竟的事业。
此诚天地祖宗之鸿庥，薄海内外之大庆也。
这场战争也让吴三桂达到了自己人生的顶点，作为清王朝定鼎中原的功勋级人物，他也在政治的前台释放着自己的能量。在这场战争结束之后，吴三桂开始经营自己的封地：云贵等地。
此地区自古以来就是烟瘴之地，土司与朝廷之间若即若离，在康熙刚刚继位的几年，云贵地区经常会发生土司叛乱，吴三桂平息了这其中的大部分，同时利用改土归流的方法，瓦解着地方土司的势力。
不过，久经沙场的吴三桂自然懂得养寇自重的道理，对于当地的土司叛乱，吴三桂往往在取得决定性胜利的前一刻收手，留着这些人用以作为向朝廷提意见的资本。同时，改土归流的施行也让吴三桂获得了该地区官员任免的权力。
经济方面，吴三桂不但有征税的权力，朝廷每年还要拨付近2000万两白银以供应吴三桂的军队。但是，吴三桂并不满足于此，他在垄断盐业及采矿业等暴利行业的同时，还与西藏商人甚至于荷兰人、东南亚商人保持着密切的联系。
如此情况下，吴三桂成为当地的土皇帝也就是理所当然的事情了。而随着国家的统一，三藩从清王朝的宝贝沦为了累赘。
但是，不管是顺治皇帝还是康熙初年的四位辅政大臣，似乎都对于三藩尤其是吴三桂持非常大的宽容态度。
尽管对于三藩的用度、政治以及经济问题，朝中有不少人上奏反对，但是四位辅臣却熟视无睹，依然任由三位藩王我行我素。
户部曾明文上奏皇帝：
合计天下正赋止八百七十五万余两，而云南一省需银九百余万，竭天下之正赋不足供一省之用。
尽管已经明文至此，朝中对于吴三桂还是没有采取任何的措施。数月后，四川道御史杨素蕴公开弹劾吴三桂：
奉差部曹亦在其内，臣不胜骇异！夫用人，国家之大权，惟朝廷得主之。
杨素蕴公开呼吁朝廷收回吴三桂任免官员的权力，但是在四位辅政大臣的操作之下，吴三桂并没有受到任何的惩罚，反而是杨素蕴被罢官免职。这似乎是在对吴三桂进行安抚。
需要强调一点，吴三桂要比尚可喜、耿继茂的地位高得多，后者与地方督抚平起平坐，而前者则远高于地方督抚。
尽管四位辅臣极力地维护三藩的地位与权力，但还是在1665年采取了一定的措施，鳌拜下令遣散了吴三桂麾下的近万人士兵，也算是对朝中舆论的回应。
但一直到鳌拜的政治生涯结束，四位辅臣都不愿意正面与吴三桂发生冲突。
原因无外乎以下几个：
首先说，吴三桂作为满清定鼎中原最大的功臣之一，此时对其动手难免有鸟尽弓藏之嫌，如此一来会激起其他的矛盾。
第二，投鼠忌器。吴三桂手里毕竟有一支常备军队，如果真的与吴三桂发生冲突，清王朝没有绝对的胜算，清军入关此时已经二十余年了，战斗力是否还如入关时一般，恐怕是要打一个问号。从日后三藩之乱的进程来看，清军的战斗力的确是下降得厉害。
最后，吴三桂与四辅臣一样，都是大清的功臣，出于对此的敬畏，他们也不会轻易地对其动手，兔死狐悲，人之常情。
一些网友特别有意思，会问一些有趣的问题，鳌拜和吴三桂两个人到底谁厉害，这两个人的确没有交锋记录，但是如果单打独斗，吴三桂绝对不是鳌拜的对手，但是行军布阵，鳌拜与吴三桂，恐怕是在伯仲之间。谁也没有十足的把握，这也是四辅臣一位迁就吴三桂的根本原因。
不过，事情在康熙亲政后的第一年便发生了转折，康熙皇帝下令增加军队中外佐领的数量。敏感的吴三桂敏锐地感觉到这是冲着自己来的。因此，吴三桂开始试探朝廷，向皇帝请求致仕，没有任何政治经验的小皇帝居然同意了吴三桂的请求。
这也让吴三桂看清楚了康熙皇帝的底牌，于是要求手下人上书康熙反对吴三桂致仕，尽管康熙皇帝表示如果西南地区出现了问题，平西王可以自己处理，但一直到吴三桂反清，康熙也没有让他官复原职。
不仅如此，康熙皇帝还不断地拨动吴三桂敏感的神经。1668年，原云南巡抚致仕，吴三桂按照往常的惯例，自己提名云南巡抚的候选人，之后报备吏部，这在之前是在平常不过的事情。
但这次到了康熙这里，康熙却明确表示：
这话一出，吴三桂反清的想法也就被激起了。蜚鸟尽，良弓藏；狡兔死，走狗烹。
在1673年康熙皇帝决定派兵平叛三藩之后，四辅臣曾经对于三藩的纵容态度，受到了皇帝的严厉批评。但是，可能皇帝自己也没有想到，这场战争会持续八年，甚至差点逼得康熙迁都回东北了。
这一切，都在于康熙低估了吴三桂的实力。实际上，对于吴三桂两种截然不同的态度，无非就是出于对吴三桂和清廷之间实力对比的判断。年轻的小皇帝错误地估计了满洲八旗的实力，从而在战争伊始，几乎丢掉了半壁江山，不得已启用汉兵。
也是因为吴三桂的优柔寡断，总想着和清廷划江而治，使其错过了消灭清廷的最佳时机。此消彼长之间，吴三桂被清廷消灭。
这场战争，也让康熙皇帝长了教训，自此之后，皇帝的指令也不像年轻时候那么鲁莽了。说穿了，当时的皇帝还是太年轻，他认为鳌拜和吴三桂属于一个类型，既然可以轻松地用皇帝的威严摆平鳌拜，也一样能制服吴三桂。
但是，有句话叫将在外，军令有所不受呀。皇帝的威严是与和皇帝的距离成反比的，一味地恫吓且不知道安抚，吴三桂势必会反的。
不过，尽管付出了很大的代价，这场战争的胜利也加速了康熙对于国家的整合，促进了国家的统一，为历史上的康乾盛世打下了基础。
塞翁失马，焉知非福？