对于育龄期的女性，子宫内膜的厚度在月经周期的不同时期也不同，在正常情况下,女性的子宫内膜厚度为8–15毫米,但最低不能低于6毫米。如果内膜太薄，小于6毫米，怀孕的几率就会减少。如果太厚了，超过20毫米，可能会导致月经量过多。
有的女性在首次月经来潮后，先天就具有痛经的表现，而有的女性本来没有痛经，最近几年发现痛经，并且越来越明显，这时一定要警惕子宫内膜异位症，应该去医院做B超等相关的检查，进一步明确诊断。
对于已经进入绝经期的女性，子宫内膜的厚度在5毫米以内是正常的，因为这个阶段的女性不会再生育，体内雌激素水平也已经下降，所以子宫内膜会变薄。如果绝经期子宫内膜超过5毫米，就要进一步检查，排除子宫内膜的病变。
但是这些脱落的内膜和出血不能顺利排出去，只能在腹腔或者盆腔里留并引起局部的炎症粘连等反应，引起局部疼痛，所以子宫内膜异位症患者常有明显的痛经。另外这些脱落物积攒多了可能会形成一个结节或囊肿，如果子宫内膜长在卵巢上，最后形成的囊肿就叫卵巢子宫内膜异位囊肿，因为常常会形成巧克力样的粘稠褐色液体，也叫巧克力囊肿。
子宫内膜异位症除了引起痛经，还可能导致不孕。因为异位的子宫内膜如果长在输卵管和卵巢时，会引起粘连，甚至把它们包裹起来，对正常的排卵和受精卵的输送会造成影响。异位的子宫内膜长期破裂出血也会引起盆腔的炎症，使盆腔的环境变差，从而影响怀孕。